RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530747.5

ARHGEF12-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF12, Length 1,930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-210ENST00000530747 TNNQ9UQP3 1299 aa5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 H0YGN5 161 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 BHLHE40O14503 412 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CHST10O43529 356 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CREG1O75629 220 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 GABRA1P14867 456 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAHP16930 419 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CD72P21854 359 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 NTF4P34130 210 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 LIPAP38571 399 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CD200P41217 278 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 AKR1C3P42330 323 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CCL11P51671 97 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PTTG1IPP53801 180 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 RRADP55042 308 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 BNIP3Q12983 259 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 FGFBP1Q14512 234 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OXA1LQ15070 435 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PSG5Q15238 335 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 AGKQ53H12 422 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM42Q69YG0 159 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 Q7L0L9 218 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 LINGO2Q7L985 606 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CADM2Q8N3J6 435 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC5A8Q8N695 610 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 MROQ9BYG7 248 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 MMP28Q9H239 520 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 NFU1Q9UMS0 254 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PDE10AQ9Y233 779 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 FLT4P35916 1363 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ARAP1Q96P48 1450 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TAF1P21675 1872 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CPED1A4D0V7 1026 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ANHXE9PGG2 379 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SIGLEC6O43699 453 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR8U9P0C7N5 309 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 GNRHRP30968 328 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 BRCC3P46736 316 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SOX2P48431 317 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 NUDT6P53370 316 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PLP1P60201 277 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 RAP1AP62834 184 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TPBGQ13641 420 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PSMD5Q16401 504 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PPM1JQ5JR12 505 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 IDNKQ5T6J7 187 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 RESP18Q5W5W9 173 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 LEMD1Q68G75 181 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM225Q6GV28 225 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 C4orf32Q8N8J7 132 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM110BQ8TC76 370 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM203Q969S6 136 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SFRP2Q96HF1 295 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 RASL10BQ96S79 203 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ARHGEF12-210ENST00000530747 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms