RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF524Q96C55 264 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KLHL29Q96CT2 875 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC7A10Q9NS82 523 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OXSMQ9NWU1 459 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 REV1Q9UBZ9 1251 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 VWA7Q9Y334 891 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AUP1Q9Y679 476 aa5□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MAGEB16A2A368 324 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GJE1A6NN92 205 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRAPPC2LH3BP13 241 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 M0R233 179 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF195O14628 629 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PIP5K1BO14986 540 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GPR37O15354 613 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PLOD3O60568 738 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IGKV3-15P01624 115 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CRYBA1P05813 215 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NGFRP08138 427 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CELA3BP08861 270 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MLNP12872 115 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MAGEA1P43355 309 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ASMTP46597 345 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EVX1P49640 407 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC16A1P53985 500 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEC24CP53992 1094 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD69Q07108 199 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SNX1Q13596 522 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CRYMQ14894 314 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR4D1Q15615 310 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRADDQ15628 312 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DECR1Q16698 335 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C4orf22Q6V702 233 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PARP8Q8N3A8 854 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TMEM86BQ8N661 226 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GATSQ8NAP1 163 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FBXO27Q8NI29 283 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TBX15Q96SF7 602 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RBBP8Q99708 897 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NELFAQ9H3P2 528 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MARCH7Q9H992 704 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EMC3Q9P0I2 261 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 U3KQK5 164 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMTNL1A8MU46 457 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 H0YIV9 168 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OIP5O43482 229 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KLK1P06870 262 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FUT4P22083 530 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MPGP29372 298 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ALDH3B1P43353 468 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 VPS41P49754 854 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 UBASH3AP57075 661 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SELENBP1Q13228 472 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CD226Q15762 336 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms