RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 CGAP01215 116 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 BMP2P12643 396 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 KRTAP10-9P60411 292 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 GALNT8Q9NY28 637 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 A0A1W2PP18 115 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 SYNGR4O95473 234 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 BCHEP06276 602 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 PCYT1AP49585 367 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CRISP3P54108 245 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 FADDQ13158 208 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 FAM222BQ8WU58 562 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 A0A0G2JND7 137 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CD8BP10966 210 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 IL7RP16871 459 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CPA2P48052 419 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 SIRPAP78324 504 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 GNA13Q14344 377 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM19Q96HH6 336 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 TIGARQ9NQ88 270 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 GLRX2Q9NS18 164 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 VAPAQ9P0L0 249 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM200B-218ENST00000512855 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 A0A0G2JPF8 293 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 NUDT7P0C024 238 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 RYKP34925 604 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 MERTKQ12866 999 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF563Q8TA94 476 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 RNF128Q8TEB7 428 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 MED4Q9NPJ6 270 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 LRBAP50851 2863 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 FAM221AA4D161 298 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 CDHR4A6H8M9 788 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM247A6NEH6 219 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 FAAHO00519 579 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 SLC7A1P30825 629 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 GRINAQ7Z429 371 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 VRK2Q86Y07 508 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 TSPEARQ8WU66 669 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PDZD2O15018 2839 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 A0A1W2PNR3 127 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 AP3D1O14617 1153 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 THBS1P07996 1170 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM200B-218ENST00000512855 RAC3P60763 192 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms