RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494607.5

PQLC1-208, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-208	ENST00000494607	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PTPN13	Q12923	2485 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	FCGR2A	P12318	317 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	GP1BB	P13224	206 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	DLX5	P56178	289 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SESN3	P58005	492 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	MERTK	Q12866	999 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SGCB	Q16585	318 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	RABL3	Q5HYI8	236 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	GRINA	Q7Z429	371 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	GGN	Q86UU5	652 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	TREML1	Q86YW5	311 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	KLHL15	Q96M94	604 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	RLIM	Q9NVW2	624 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF175	Q9Y473	711 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607		A0A0G2JNJ9	132 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607		A1L4Q6	167 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC22A20	A6NK97	555 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	AIM2	O14862	343 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ADAMDEC1	O15204	470 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PCGF2	P35227	344 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CLDN15	P56746	228 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	COPZ1	P61923	177 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	EPS8	Q12929	822 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	VMAC	Q2NL98	169 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	OR2A2	Q6IF42	318 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	NPAS1	Q99742	590 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PINK1	Q9BXM7	581 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607		Q9UFV3	132 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	NDUFAB1	O14561	156 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	DVL2	O14641	736 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	TOX	O94900	526 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CLDN1	O95832	211 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	AQP1	P29972	269 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC7A1	P30825	629 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SFTPD	P35247	375 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC1A3	P43003	542 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	NUDT2	P50583	147 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	MAP2K6	P52564	334 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	HBM	Q6B0K9	141 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	OR10D3	Q8NH80	312 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ADGRG7	Q96K78	797 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607		H0YC42	278 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PQLC1-208	ENST00000494607	AP3D1	O14617	1153 aa		14.46	□□□□□ -0.09

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