RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A14Q96JA4 679 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MCHR1Q99705 422 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA16Q9BXB7 569 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GNA14O95837 355 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LALBAP00709 142 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 POU2F1P14859 743 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CASP4P49662 377 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CUL1Q13616 776 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PRR4Q16378 134 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM16LQ309B1 348 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SBK1Q52WX2 424 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SFT2D3Q587I9 215 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TPGS2Q68CL5 300 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ATL3Q6DD88 541 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-212ENST00000491302 VITQ6UXI7 678 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-212ENST00000491302 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL4Q99706 377 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PHF11Q9UIL8 331 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PDE10AQ9Y233 779 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PLLPQ9Y342 182 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 WWP2O00308 870 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ECI2O75521 394 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZP3P21754 424 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD10P28358 340 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-212ENST00000491302 MEOX2P50222 304 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-212ENST00000491302 PLK1P53350 603 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNB3Q05901 458 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 UTF1Q5T230 341 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GPD1LQ8N335 351 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SVOPLQ8N434 492 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FGGYQ96C11 551 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TCHPQ9BT92 498 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RAB34Q9BZG1 259 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MEMO1Q9Y316 297 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GWB2 263 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y8G0 127 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF254O75437 659 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 AP2A1O95782 977 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IGHG4P01861 327 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 VDAC1P21796 283 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 SULT1E1P49888 294 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA2P54652 639 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 LYG1Q8N1E2 194 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF525Q8N782 197 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 FAF2Q96CS3 445 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF670Q9BS34 389 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 SGK2Q9HBY8 427 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HYPKQ9NX55 129 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 OR10H3O60404 316 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 HMMRO75330 724 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 PCMT1P22061 227 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA13P27216 316 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 GCAP28676 217 aa5.76□□□□□ -1.49
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