RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SSX9	Q7RTT3	188 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM25	Q86YD3	366 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR4F5	Q8NH21	305 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHYHIP	Q92561	330 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CDKL2	Q92772	493 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OMA1	Q96E52	524 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CYTH2	Q99418	400 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TSG101	Q99816	390 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CTRC	Q99895	268 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CD209	Q9NNX6	404 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATA2	Q9UM82	520 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PTPRF	P10586	1907 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.54	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		A8MXQ7	604 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		K7ERQ8	282 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CCL24	O00175	119 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RAD51C	O43502	376 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC22	O60826	627 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RAMP3	O60896	148 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CCL2	P13500	99 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PSMB6	P28072	239 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RAP1GDS1	P52306	607 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLA2G16	P53816	162 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GNG2	P59768	71 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HERV-K104	P61576	105 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PPIL2	Q13356	520 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GNA13	Q14344	377 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KMT5C	Q86Y97	462 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR2T12	Q8NG77	320 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MYLPF	Q96A32	169 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RTP4	Q96DX8	246 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MTERF3	Q96E29	417 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FMO2	Q99518	471 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C12orf10	Q9HB07	376 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CLN8	Q9UBY8	286 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CD300A	Q9UGN4	299 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TFR2	Q9UP52	801 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBTB5	O15062	677 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AQP9	O43315	295 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	EFNA2	O43921	213 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CRCP	O75575	148 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GRAP2	O75791	330 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SCGN	O76038	276 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PMS2P2	O95744	297 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GAS8	O95995	478 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FH	P07954	510 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R2	P41236	205 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MAGEA1	P43355	309 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	B2M	P61769	119 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF85	Q03923	595 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LIPE	Q05469	1076 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GK3P	Q14409	553 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TGFBI	Q15582	683 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNJ8	Q15842	424 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		2.53	□□□□□ -2

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