RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	COX18	Q8N8Q8	333 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52J3	Q8NH60	311 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4C6	Q8NH72	309 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP25	Q8TEE9	199 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GGH	Q92820	318 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RIT1	Q92963	219 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	YIPF6	Q96EC8	236 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		Q96MT0	163 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	COG8	Q96MW5	612 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DACH2	Q96NX9	599 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM7	Q96PF1	710 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GPA33	Q99795	319 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LHPP	Q9H008	270 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FANCE	Q9HB96	536 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EQTN	Q9NQ60	294 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	STARD5	Q9NSY2	213 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CUTC	Q9NTM9	273 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MED17	Q9NVC6	651 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IL20	Q9NYY1	176 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRODH2	Q9UF12	536 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		U3KQA8	63 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN24	A6NM45	220 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EFCAB7	A8K855	629 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	T	O15178	435 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SDC3	O75056	442 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM20B	O75063	409 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2B3	O76000	313 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB1D2	O95969	90 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NGFR	P08138	427 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	INHBB	P09529	407 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRA3	P34903	492 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CNR2	P34972	360 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PCYT1A	P49585	367 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CTBP2	P56545	445 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R41	P59536	307 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF7	P61962	342 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IL1RL1	Q01638	556 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RHAG	Q02094	409 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ID2	Q02363	134 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	STX4	Q12846	297 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFBP1	Q14512	234 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NCF4	Q15080	339 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NEDD8	Q15843	81 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CTF1	Q16619	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		5.1	□□□□□ -1.59

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