RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TPSB2P20231 275 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GCH1P30793 250 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PGM1P36871 562 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 LHX2P50458 406 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 EFNA4P52798 201 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GAS1P54826 345 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CLDN18P56856 261 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TUBA1BP68363 451 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SPOCK1Q08629 439 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 FUT7Q11130 342 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RUNX2Q13950 521 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TOMM20Q15388 145 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TRIP10Q15642 601 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TPSAB1Q15661 275 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TEX44Q53QW1 395 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 LEG1Q6P5S2 330 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HSDL2Q6YN16 418 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RDH11Q8TC12 318 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 S100PBPQ96BU1 408 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PYCR2Q96C36 320 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PKP4Q99569 1192 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 DOHHQ9BU89 302 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 AICDAQ9GZX7 198 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SLITRK2Q9H156 845 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 NDST4Q9H3R1 872 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PARVAQ9NVD7 372 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SPACA6W5XKT8 324 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.75□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 BICDL2A1A5D9 508 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 B4DXG7 233 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TXNDC9O14530 226 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 EMC8O43402 210 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HCRTR2O43614 444 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ETHE1O95571 254 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CH25HO95992 272 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 EPOP01588 193 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 FTH1P02794 183 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ERGP11308 486 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ADRA2CP18825 462 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 IL10P22301 178 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RYKP34925 604 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ADRA1AP35348 466 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HNF4AP41235 474 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 PDLIM4P50479 330 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CDH11P55287 796 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CDH15P55291 814 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 FBXW4P57775 412 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TAS2R40P59535 323 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RAB8AP61006 207 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GUSBP1Q15486 140 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 TAB1Q15750 504 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GPR33Q49SQ1 333 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 OPN5Q6U736 354 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ASPGQ86U10 573 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CA13Q8N1Q1 262 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 ZNF721Q8TF20 911 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 RAPGEF5Q92565 580 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 UCN3Q969E3 161 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 LRRC58Q96CX6 371 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HBEGFQ99075 208 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SYT11Q9BT88 431 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 GALPQ9UBC7 116 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.74□□□□□ -1.81
CNN3-206ENST00000487539 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms