RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 OCEL1Q9H607 264 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 REEP1Q9H902 201 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MED17Q9NVC6 651 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 AP4S1Q9Y587 144 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 V9GYQ6 96 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MED13Q9UHV7 2174 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN24A6NM45 220 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 M0R3H8 397 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 BCKDKO14874 412 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CHP2O43745 196 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TPST1O60507 370 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 E2F6O75461 281 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GADD45GO95257 159 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CST1P01037 141 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PDGFAP04085 211 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GKN3PP0CG01 181 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TFPIP10646 304 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FASP25445 335 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEA5P43359 124 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OR1E2P47887 323 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NUP107P57740 925 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SESN3P58005 492 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FOXO1Q12778 655 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NFATC3Q12968 1075 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 LY6DQ14210 128 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OR1Q1Q15612 314 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 WLSQ5T9L3 541 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DESI1Q6ICB0 168 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CBLN3Q6UW01 205 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 AMER2Q8N7J2 671 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 EXD3Q8N9H8 876 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FAR1Q8WVX9 515 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HES7Q9BYE0 225 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DEPPQ9NTK1 212 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 A8MVM7 634 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PRRG2O14669 202 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF208O43345 1280 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 LDLRP01130 860 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2ABP04908 130 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 EDN3P14138 238 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GABRA1P14867 456 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ABOP16442 354 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PRKCAP17252 672 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ATP6V1B2P21281 511 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TACR3P29371 465 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PTGER4P35408 488 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RFC3P40938 356 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CD97P48960 835 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RAC1P63000 192 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SPIBQ01892 262 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 BCL2A1Q16548 175 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SGCBQ16585 318 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FGD3Q5JSP0 725 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DCST1Q5T197 706 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ATCAYQ86WG3 371 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms