RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB18Q99592 522 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C7orf72A4D263 438 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM64BA6NI03 449 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 E9PBE3 544 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LYZL6O75951 148 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SOX30O94993 753 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ANP32DO95626 131 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FESP07332 822 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 YES1P07947 543 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NR2F1P10589 423 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PPP3CBP16298 524 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ELK4P28324 431 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EPHA3P29320 983 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NR1H2P55055 460 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SESN3P58005 492 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OR2B6P58173 313 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 UFM1P61960 85 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LTBQ06643 244 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FAPQ12884 760 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SELENBP1Q13228 472 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MPP2Q14168 576 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SHEQ5VZ18 495 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RNF130Q86XS8 419 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MREGQ8N565 214 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RNF128Q8TEB7 428 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ROPN1LQ96C74 230 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SORT1Q99523 831 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 INPP5KQ9BT40 448 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LAT2Q9GZY6 243 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS50Q9UI38 385 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ROS1P08922 2347 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PR80 420 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CIB4A0PJX0 185 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM120BA0PK00 339 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC154A6NI56 674 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN24A6NM45 220 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KLF4O43474 513 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SCN2BO60939 215 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 UGT2B17O75795 530 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 H6PDO95479 791 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AGR2O95994 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AK1P00568 194 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C1QCP02747 245 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CD3EP07766 207 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 IL7RP16871 459 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PTNP21246 168 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ADH6P28332 368 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PCSK6P29122 969 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HOXC12P31275 282 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CRATP43155 626 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DIO1P49895 249 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5J2P56134 94 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PHC1P78364 1004 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OCRLQ01968 901 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CHRNEQ04844 493 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SKP2Q13309 424 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GUSBP1Q15486 140 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF141Q15928 474 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK14Q16539 360 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SYPL1Q16563 259 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CROCCP2Q86T23 111 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BIVMQ86UB2 503 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms