RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	PORCN	Q9H237	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SBF1	O95248	1867 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	MEI4	A8MW99	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563		K7ERI5	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	OGT	O15294	1046 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SNAP91	O60641	907 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	LRP3	O75074	770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	BANF1	O75531	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	OR6B1	O95007	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ASNS	P08243	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	S100A1	P23297	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	DCK	P27707	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	HSPA1L	P34931	641 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SLC6A8	P48029	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	NUDT2	P50583	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	AIF1	P55008	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TMBIM6	P55061	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CDH6	P55285	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	KCNK10	P57789	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	BNIP2	Q12982	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ART3	Q13508	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	EMC2	Q15006	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	MOG	Q16653	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CGREF1	Q99674	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	RBBP8	Q99708	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	DCX	O43602	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZFAND5	O76080	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	VAPB	O95292	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	CHRNG	P07510	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	GPR183	P32249	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ARL2	P36404	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	FHIT	P49789	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-227	ENST00000470563	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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