RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXO5Q9H790 373 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5DC2Q9H857 520 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR41Q9HAD4 459 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPG11Q96JI7 2443 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0YIV9 168 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGRMC2O15173 223 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH7O60245 1069 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTNSO60931 367 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFAND5O76080 213 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT7LO94864 414 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN9O95484 217 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTCP00480 354 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-DQA2P01906 255 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLPSP04118 112 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHBGP04278 402 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 P04436 131 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL3P08700 152 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX6B1P14854 86 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDF1P27539 372 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3R1P27986 724 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR1EP28566 365 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF8P28908 595 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMOX2P30519 316 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB9P50453 376 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK12P53778 367 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW4P57775 412 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGCS1Q01581 520 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERTAD2Q14140 314 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOMM20Q15388 145 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR68Q15743 365 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIPJQ5W064 366 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRG2Q64ET8 278 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTL4Q6ZR62 310 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM57BQ71RH2 274 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAIQ8N9R8 606 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MORN4Q8NDC4 146 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD9Q8NE22 299 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGR3Q8TD06 166 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIT1Q92963 219 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF125Q96EQ8 232 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOPT1Q96IL0 206 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF597Q96LX8 424 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRG2BQ96QU4 278 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMC6Q96SB8 1091 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUZQ9BT04 418 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITPAQ9BY32 194 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEMO1Q9Y316 297 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB4Q9Y574 426 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.03□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA4P78363 2273 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPM1 405 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf51A8MQB3 221 aa4.02□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms