RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433165.6

CNKSR3-202, Transcript of CNKSR family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNKSR3, Length 2,347 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR3-202ENST00000433165 ANTXRLA6NF34 631 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 DVL2O14641 736 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 TM4SF5O14894 197 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 KDM4BO94953 1096 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 RASGRP1O95267 797 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 IGSF6O95976 241 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 IGHA1P01876 353 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 WNT1P04628 370 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 RORAP35398 523 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 MAPK8P45983 427 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 DGCR2P98153 550 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 E2F1Q01094 437 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 CHIT1Q13231 466 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 PTPRRQ15256 657 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 TMUB2Q71RG4 321 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 KAT2AQ92830 837 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 RGMAQ96B86 450 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 ORAI1Q96D31 301 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 JAM3Q9BX67 310 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 BRF2Q9HAW0 419 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 RASD1Q9Y272 281 aa7.15□□□□□ -1.26
CNKSR3-202ENST00000433165 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 A0A1B0GVC2 190 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 A0A1B0GW55 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 A6NIN4 97 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 CTDSPLO15194 276 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 KDELR3O43731 214 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 GDF9O60383 454 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 C6orf47O95873 294 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 MT-ND4P03905 459 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 HIST1H2ABP04908 130 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 IFNGR1P15260 489 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 CD22P20273 847 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DRD5P21918 477 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 MMP11P24347 488 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 ACRV1P26436 265 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 RFC3P40938 356 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 ADPRHP54922 357 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 SMIM11AP58511 58 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 PITPNAQ00169 270 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DEFA5Q01523 94 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 MC2RQ01718 297 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 REEP3Q6NUK4 255 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 DEF8Q6ZN54 512 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TPRA1Q86W33 373 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.15□□□□□ -1.27
CNKSR3-202ENST00000433165 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms