RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ARCQ7LC44 396 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KIR3DL3Q8N743 410 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RAET1EQ8TD07 263 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 C7orf33Q8WU49 177 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LINC00167Q96N53 147 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RIT2Q99578 217 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NARFLQ9H6Q4 476 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KIF13AQ9H1H9 1805 aa2.86□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF11O15085 1522 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 A8MUI8 341 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PRKYO43930 277 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 UGT2B17O75795 530 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SLITRK3O94933 977 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LALBAP00709 142 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RNH1P13489 461 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 DRD5P21918 477 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CA8P35219 290 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PRKXP51817 358 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 AP3M2P53677 418 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 HSPA2P54652 639 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CCDC173Q0VFZ6 552 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GTF3C1Q12789 2109 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TPRA1Q86W33 373 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RNF138Q8WVD3 245 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ELSPBP1Q96BH3 223 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D31Q96DN5 1066 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 EBF4Q9BQW3 602 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TPPP3Q9BW30 176 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF385DQ9H6B1 395 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 DCDC2Q9UHG0 476 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 THSD7BQ9C0I4 1608 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 A0A1B0GWJ7 208 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 USP27XA6NNY8 438 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 BBOX1O75936 387 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LRATO95237 230 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 HEXBP07686 556 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TSPY4P0CV99 314 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TSPY10P0CW01 314 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V1C1P21283 382 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PAX7P23759 505 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CD1BP29016 333 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 LEPP41159 167 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PLK1P53350 603 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 APOC4P55056 127 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 BIDP55957 195 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CHRNB3Q05901 458 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PYHIN1Q6K0P9 492 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ARMCX2Q7L311 632 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 VRK2Q86Y07 508 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR56B4Q8NH76 319 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR1E3Q8WZA6 343 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 FAM3CQ92520 227 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 RAPGEF5Q92565 580 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ARHGDIGQ99819 225 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 GAL3ST1Q99999 423 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SPATA16Q9BXB7 569 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NANOGQ9H9S0 305 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 ELOVL3Q9HB03 270 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.956e-39■□□□□ 8.5
RBM39-211ENST00000426951 TMOD2Q9NZR1 351 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 NEU3Q9UQ49 428 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-211ENST00000426951 CHD1O14646 1710 aa2.84□□□□□ -1.96
RBM39-211ENST00000426951 RLFQ13129 1914 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-211ENST00000426951 NESP48681 1621 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.5 ms