RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384508.1

RNU6-110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-110P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF3P17036 446 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PRKACAP17612 351 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GABRG2P18507 467 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 C4BPBP20851 252 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 BCKDHBP21953 392 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 UGT1A4P22310 534 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 IL32P24001 234 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ITGA3P26006 1051 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 MARK3P27448 753 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 IL12BP29460 328 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PDHA2P29803 388 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 IL2RGP31785 369 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RORAP35398 523 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 MAP2K2P36507 400 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 DDOSTP39656 456 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 OPRD1P41143 372 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTGDSP41222 190 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 NSG1P42857 185 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SSR1P43307 286 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ALDH3B1P43353 468 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 MAGEA6P43360 314 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ABCG1P45844 678 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 HAAOP46952 286 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR3A3P47888 321 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 AVPR1BP47901 424 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RAB9AP51151 201 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARHGDIBP52566 201 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC7A2P52569 658 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 EFNB2P52799 333 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ACLYP53396 1101 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDH4P55283 916 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 BIDP55957 195 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 LINC00205P59089 165 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GPX6P59796 221 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 UBE2G2P60604 165 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ERVK11-1P61568 191 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ERVK-8P63133 956 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SKP1P63208 163 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 TNNC1P63316 161 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 OGDHQ02218 1023 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PAX5Q02548 391 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 REG3AQ06141 175 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RBBP4Q09028 425 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARL16Q0P5N6 197 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF154Q13106 437 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 STX3Q13277 289 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GPR17Q13304 367 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PMS2P3Q13401 168 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SNTA1Q13424 505 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 FHL2Q14192 279 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 TRAM2Q15035 370 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RAB35Q15286 201 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 LTB4RQ15722 352 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SSX2Q16385 188 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCL14Q16627 93 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 TATDN3Q17R31 274 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 NDUFAF6Q330K2 333 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 HSP90B2PQ58FF3 399 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 VWA2Q5GFL6 755 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDKL4Q5MAI5 379 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 UTF1Q5T230 341 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 LCE4AQ5TA78 99 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 GPR107Q5VW38 600 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SUMO4Q6EEV6 95 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 TRNP1Q6NT89 227 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RHBDD2Q6NTF9 364 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 REEP3Q6NUK4 255 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 C1orf94Q6P1W5 598 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 SCYL2Q6P3W7 929 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM122CQ6P4D5 195 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 RFWD3Q6PCD5 774 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 DOK6Q6PKX4 331 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 C6orf89Q6UWU4 347 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 PRSS57Q6UWY2 283 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 CD300LGQ6UXG3 332 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF600Q6ZNG1 722 aa0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms