RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SURF4O15260 269 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OIP5O43482 229 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATE1O95260 518 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGN1P05114 100 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF91Q05481 1191 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC43A2Q8N370 569 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GATSQ8NAP1 163 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD8Q96LT4 415 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMKLR1Q99788 373 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC19A3Q9BZV2 496 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBQLN3Q9H347 655 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HHATLQ9HCP6 504 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF806P0C7X5 589 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC6A8P48029 635 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRG3P56975 720 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YIPF6Q96EC8 236 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRELD1Q96HD1 420 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.03■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNTNA6NMZ2 147 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRODHO43272 600 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCN1O60741 890 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGF2P01344 180 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCKP06239 509 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMB9P28065 219 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCF4Q15080 339 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNLSQ5VYX0 342 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DESI1Q6ICB0 168 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBLN3Q6UW01 205 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BHLHE40O14503 412 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FADS1O60427 444 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTP4A3O75365 173 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADORA3P0DMS8 318 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMTP11086 282 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP7P18075 431 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRK5P34947 590 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUBP1P53384 320 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A5P58743 744 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAXDQ8IW45 347 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LNX2Q8N448 690 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMEPA1Q969W9 287 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.01■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAN1A2O60476 641 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBFA2T3O75081 653 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUT1P19526 365 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF117Q03924 483 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFR3AQ14156 821 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR5L2Q8NGL0 311 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM80Q96HE8 168 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHOX2BQ99453 314 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf10Q9HB07 376 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9J4A7 227 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFB5O43674 189 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPM1BO75688 479 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNA2P20248 432 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB15P59190 212 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKK1Q8NFD2 765 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MR1Q95460 341 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM43Q9BTV4 400 aa20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms