RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 TRIM2Q9C040 744 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CD8B2A6NJW9 211 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CD8BP10966 210 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CSF2RBP32927 897 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SDC2P34741 201 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 DAB2P98082 770 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 TMEM99Q8N816 258 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CHRDQ9H2X0 955 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.52■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 A0A0B4J2E0 115 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 A0A1B0GX12 115 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 DYRK3O43781 588 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SULT1C4O75897 302 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 DLGAP3O95886 979 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ITPKBP27987 946 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PPP5CP53041 499 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 HCCSP53701 268 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FN3KQ9H479 309 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FGF21Q9NSA1 209 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SERINC4A6NH21 518 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SLC30A4O14863 429 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 OIP5O43482 229 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CHP2O43745 196 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PRKCDQ05655 676 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CBLN3Q6UW01 205 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PALMDQ9NP74 551 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 KLHL1Q9NR64 748 aa15.51■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 DAPL1A0PJW8 107 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 HCN1O60741 890 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 LYPD3O95274 346 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 GAS1P54826 345 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 DSG2Q14126 1118 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZNF613Q6PF04 617 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZNF563Q8TA94 476 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CD226Q15762 336 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZNF550Q7Z398 422 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FGF11Q92914 225 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 BARHL1Q9BZE3 327 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PRODH2Q9UF12 536 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CASKO14936 926 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SOX30O94993 753 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 PIGKQ92643 395 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 TMEM5Q9Y2B1 443 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.5■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 NCR1O76036 304 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 TBXA2RP21731 343 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 HTR1FP30939 366 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 RORCP51449 518 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 SERTAD2Q14140 314 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.49■□□□□ 0.07
PKN3-201ENST00000291906 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms