RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SYPL1Q16563 259 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 LUZP2Q86TE4 346 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.11■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PNV4 684 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TMEM247A6NEH6 219 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TNFSF11O14788 317 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ADAMDEC1O15204 470 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SYNGR4O95473 234 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PRKCAP17252 672 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SFTPDP35247 375 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SKP2Q13309 424 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 QPRTQ15274 297 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 HBMQ6B0K9 141 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ANKFN1Q8N957 763 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TMEM234Q8WY98 164 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 GTF2H4Q92759 462 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ZG16BQ96DA0 208 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 KLHL15Q96M94 604 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 RNF122Q9H9V4 155 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 JKAMPQ9P055 326 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.1■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 NR5A2O00482 541 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PGCP20142 388 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 KCNJ10P78508 379 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 GNA13Q14344 377 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SQLEQ14534 574 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SPDL1Q96EA4 605 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ADGRG7Q96K78 797 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TIGARQ9NQ88 270 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 APCP25054 2843 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 A0A0J9YW62 118 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 CXCL13O43927 109 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TNFSF13O75888 250 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 CHRM4P08173 479 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 IL7RP16871 459 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 IL11P20809 199 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PGM1P36871 562 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ATP4BP51164 291 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 CARD18P57730 90 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 GTDC1Q4AE62 458 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 ZNF563Q8TA94 476 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PMM1Q92871 262 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SLC38A1Q9H2H9 487 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 HEATR5AQ86XA9 2040 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT6-210ENST00000641643 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 ETFAP13804 333 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 DSTNP60981 165 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 SIRPAP78324 504 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 SELENBP1Q13228 472 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 AGKQ53H12 422 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 ST8SIA1Q92185 356 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 OSTF1Q92882 214 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 STARD4Q96DR4 205 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 CALML5Q9NZT1 146 aa20.08■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 AGAP5A6NIR3 686 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 CLIC1O00299 241 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 MSTNO14793 375 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 AQP8O94778 261 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 RYKP34925 604 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 ARFIP2P53365 341 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 CRISP3P54108 245 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT6-210ENST00000641643 CMIPQ8IY22 773 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms