RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 HSPB3Q12988 150 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 MROH9Q5TGP6 573 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35F6Q8N357 371 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 COX18Q8N8Q8 333 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 OR4C3Q8NH37 302 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SNX18Q96RF0 628 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ACPTQ9BZG2 426 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 VPS11Q9H270 941 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.57□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 LRP5LA4QPB2 252 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SERINC4A6NH21 518 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 B4DSR2 109 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 B9A039 149 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GPR171O14626 319 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ULK1O75385 1050 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 OR4F21O95013 312 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 WNT11O96014 354 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 NPIPA8P0DM63 369 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PRPS2P11908 318 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V1C1P21283 382 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GIFP27352 417 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GPC1P35052 558 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 HILS1P60008 231 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 DEFA6Q01524 100 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 LGALS3BPQ08380 585 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 CD226Q15762 336 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 USP43Q70EL4 1123 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO27Q8NI29 283 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PIGXQ8TBF5 258 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 FBF1Q8TES7 1133 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GPR78Q96P69 363 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 OR5B2Q96R09 309 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF382Q96SR6 550 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SOX7Q9BT81 388 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SNX24Q9Y343 169 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.56□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PNR3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PR80 420 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PDPK1O15530 556 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 KCNK2O95069 426 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3-9P01782 118 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ALOX5P09917 674 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PRKCAP17252 672 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 EDNRAP25101 427 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SERPINF1P36955 418 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SLC1A3P43003 542 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 CCR4P51679 360 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 C2orf80Q0P641 193 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PDK3Q15120 406 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GABRA6Q16445 453 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO30Q8TB52 745 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 JADE3Q92613 823 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 APIPQ96GX9 242 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 CA10Q9NS85 328 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.55□□□□□ -1.2
HLA-B-257ENST00000640094 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.55□□□□□ -1.2
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