RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 LIMS1P48059 325 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CCNJQ5T5M9 372 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF786Q8N393 782 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GPR151Q8TDV0 419 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 APIPQ96GX9 242 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 BRF2Q9HAW0 419 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 VPS29Q9UBQ0 182 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 HMX2A2RU54 273 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NKX2-2O95096 273 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OR4A8P0C604 315 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 HKR1P10072 659 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ACP2P11117 423 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 IFNGR1P15260 489 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PRKCAP17252 672 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PCMT1P22061 227 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PPOXP50336 477 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CDH13P55290 713 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GRTP1Q5TC63 336 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 VHLLQ6RSH7 139 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF527Q8NB42 609 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CDKL2Q92772 493 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 APH1AQ96BI3 265 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CA10Q9NS85 328 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ASB6Q9NWX5 421 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MALT1Q9UDY8 824 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GJE1A6NN92 205 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF716A6NP11 495 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 B9A039 149 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 KLF11O14901 512 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OR4F21O95013 312 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 KCNK2O95069 426 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MSMBP08118 114 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SLC7A1P30825 629 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 HTR6P50406 440 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 EFNB3Q15768 340 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GPR119Q8TDV5 335 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OR5B2Q96R09 309 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ACPTQ9BZG2 426 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 MANBAO00462 879 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 KLHL2O95198 593 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 NUDT14O95848 222 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 ADRA2CP18825 462 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 DDCP20711 480 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 C2orf80Q0P641 193 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FOXL1Q12952 345 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SELENBP1Q13228 472 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 HEPACAMQ14CZ8 416 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 DUSP5Q16690 384 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 GIMAP5Q96F15 307 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-230ENST00000551968 JMJD8Q96S16 334 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.1 ms