RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	NRGN	Q92686	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TESC	Q96BS2	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	STAC	Q99469	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PDZD2	O15018	2839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	APC	P25054	2843 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	FREM3	P0C091	2139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	LRBA	P50851	2863 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0J9YW62	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PPR1	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048		H3BML4	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SEC14L5	O43304	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	HCRTR2	O43614	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	WDR1	O75083	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SLC22A3	O75751	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TNFSF13	O75888	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	KCNH1	O95259	989 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ATE1	O95260	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	NGFR	P08138	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PEPD	P12955	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ETFA	P13804	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CAPN3	P20807	821 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	BMP5	P22003	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	UQCRC2	P22695	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	EDNRA	P25101	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CFP	P27918	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CHRNB4	P30926	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	S100A3	P33764	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TIMP3	P35625	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	KRT20	P35900	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SMS	P52788	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ATP12A	P54707	1039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	AQP5	P55064	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CHRNE	Q04844	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	FOXF1	Q12946	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	GPR68	Q15743	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF141	Q15928	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-234	ENST00000546048	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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