RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544179.1

TM7SF3-216, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TM7SF3, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-216ENST00000544179 UBAC1Q9BSL1 405 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC22A4Q9H015 551 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NAPBQ9H115 298 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 DIABLOQ9NR28 239 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CDH9Q9ULB4 789 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ADGRL1O94910 1474 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MYOM2P54296 1465 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NOS1P29475 1434 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NCAPD2Q15021 1401 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CD109Q6YHK3 1445 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 A0A1W2PPV4 95 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ASB14A6NK59 587 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MPTX1A8MV57 137 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 A8MXQ7 604 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 C17orf105B2RV13 164 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 EPM2AB3EWF7 344 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 E5RI56 91 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 BET1O15155 118 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CHADO15335 359 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF264O43296 627 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 LANCL1O43813 399 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SELENOFO60613 162 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SCN2BO60939 215 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CDH16O75309 829 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SAP30O75446 220 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SEC24AO95486 1093 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MBD3O95983 291 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 VTNP04004 478 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ATP1B1P05026 303 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SERPINA6P08185 405 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CD59P13987 128 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NQO2P16083 231 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PSMB6P28072 239 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC1A1P43005 524 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CDH4P55283 916 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTBP60709 375 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTA2P62736 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTG1P63261 375 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTG2P63267 376 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 TNNC1P63316 161 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTC1P68032 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ACTA1P68133 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CSNK1G2P78368 415 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MADCAM1Q13477 382 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 RCAN2Q14206 197 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PDK2Q15119 407 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CAMK4Q16566 473 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 CDO1Q16878 200 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 HES5Q5TA89 166 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 LIPNQ5VXI9 398 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 WSCD1Q658N2 575 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 Q8N377 158 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 LRTM2Q8N967 370 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 OR2L2Q8NH16 312 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 OR52N1Q8NH53 320 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NCOA7Q8NI08 942 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NELFBQ8WX92 580 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 PIK3R3Q92569 461 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 TOP1MTQ969P6 601 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 NTAN1Q96AB6 310 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 DTD2Q96FN9 168 aa3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms