RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541615.5

SNHG1-218, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNHG1, Length 748 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-218ENST00000541615 OR2F2O95006 317 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SCELO95171 688 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 EOMESO95936 686 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TCRBP04435 133 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 IL5P05113 134 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 F13BP05160 661 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF735P0CB33 412 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 GIMD1P0DJR0 217 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 F3P13726 295 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ACPPP15309 386 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ITGB5P18084 799 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 IL11P20809 199 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MC4RP32245 332 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 IRS1P35568 1242 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 PBX3P40426 434 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MAGEA12P43365 314 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 DLX5P56178 289 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TAS2R38P59533 333 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 UBE2G2P60604 165 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TIMM10P62072 90 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 HOXC5Q00444 222 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OGDHQ02218 1023 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 IRF8Q02556 426 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 FPGSQ05932 587 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MADCAM1Q13477 382 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MAMLD1Q13495 774 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR2F1Q13607 317 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 RUNX2Q13950 521 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 DPYSL3Q14195 570 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 GAS6Q14393 721 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.632e-8■□□□□ 9.6
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF345Q14585 488 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 NTRK2Q16620 822 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 IQCJQ1A5X6 159 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 GSG1Q2KHT4 349 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR10K2Q6IF99 312 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TMEM270Q6UE05 265 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 DPPA4Q7L190 304 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TCF24Q7RTU0 167 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF605Q86T29 641 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 PIM3Q86V86 326 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 LAX1Q8IWV1 398 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MIER2Q8N344 545 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 DNERQ8NFT8 737 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 OR52J3Q8NH60 311 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 NUBPLQ8TB37 319 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 CD200R1Q8TD46 325 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 FAM162AQ96A26 154 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ARSGQ96EG1 525 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MFSD3Q96ES6 412 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 KCTD7Q96MP8 289 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 PNMA5Q96PV4 448 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MMP19Q99542 508 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 EPYCQ99645 322 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MGLLQ99685 303 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 BCO2Q9BYV7 579 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ARV1Q9H2C2 271 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 ACTL8Q9H568 366 aa4.85□□□□□ -1.63
SNHG1-218ENST00000541615 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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