RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 CSTAP01040 98 aa4.9□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 ZNF806P0C7X5 589 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 CDK4P11802 303 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 POU2F1P14859 743 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TBXA2RP21731 343 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 MMP11P24347 488 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 POU1F1P28069 291 aa4.9□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 A0A0B4J2E0 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 A0A1B0GX12 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 UNC119BA6NIH7 251 aa4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 IDSB3KWA1 339 aa4.89□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 C9J4A7 227 aa4.89□□□□□ -1.63
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