RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 ACER3Q9NUN7 267 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TRAPPC6AO75865 159 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 EPPINO95925 133 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CST1P01037 141 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SEMG1P04279 462 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 DPP4P27487 766 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 GDF1P27539 372 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ADH6P28332 368 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SRD5A2P31213 254 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 MAGEA2P43356 314 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 QPRTQ15274 297 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 OR1Q1Q15612 314 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RRM2BQ7LG56 351 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 GRINAQ7Z429 371 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RNF217Q8TC41 542 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 MPP4Q96JB8 637 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 MRGPRX4Q96LA9 322 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 C12orf10Q9HB07 376 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TMCC3Q9ULS5 477 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 FRS3O43559 492 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 GMFGO60234 142 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 LDLRP01130 860 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 HK1P19367 917 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TNFRSF1BP20333 461 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CXCR1P25024 350 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ERFP50548 548 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF136P52737 540 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 PPIAP62937 165 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 VLDLRP98155 873 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SLC10A1Q14973 349 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TRAM2Q15035 370 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 LINC00471Q8N535 108 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 OR2T29Q8NH02 315 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 PIGQQ9BRB3 760 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 MFRPQ9BY79 579 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 HES7Q9BYE0 225 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 REEP1Q9H902 201 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 DEPPQ9NTK1 212 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 MED17Q9NVC6 651 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 CLOCKO15516 846 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 GADD45GO95257 159 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 BAG2O95816 211 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 H1F0P07305 194 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 PRG2P13727 222 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF17P17021 662 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SESN3P58005 492 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 HOXC5Q00444 222 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SPIBQ01892 262 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 FOXO1Q12778 655 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 KLRB1Q12918 225 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ELOA3BQ3SY89 546 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 COLEC12Q5KU26 742 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 LACC1Q8IV20 430 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 ELOA3Q8NG57 546 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SLC38A4Q969I6 547 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 FBXL2Q9UKC9 423 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-205ENST00000527006 VDAC3Q9Y277 283 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms