RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PGC	P20142	388 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CD9	P21926	228 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CPN2	P22792	545 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP11	P24347	488 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXD10	P28358	340 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CD1B	P29016	333 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2R1B	P30154	601 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT1A5	P35504	534 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RY1	P47900	373 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC7A2	P52569	658 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	EFNB2	P52799	333 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN8	P56748	225 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OGDH	Q02218	1023 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SBK1	Q52WX2	424 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SFT2D3	Q587I9	215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T11	Q8NH01	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DYRK2	Q92630	601 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC38A4	Q969I6	547 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPNS2	Q96L46	248 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PRRC1	Q96M27	445 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MTMR9	Q96QG7	549 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AHSP	Q9NZD4	102 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TCF19	Q9Y242	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DHRS7	Q9Y394	339 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	USP6	P35125	1406 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SSH2	Q76I76	1423 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GUV1	79 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PNV4	684 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX46	H3BTG2	121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	WWP2	O00308	870 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	INPP4B	O15327	924 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE5A	O76074	875 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TOX	O94900	526 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CST1	P01037	141 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CGA	P01215	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYGB	P07316	175 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	H2BFM	P0C1H6	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IMPDH1	P20839	514 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBG1	P23258	451 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GNPDA1	P46926	289 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STAR	P49675	285 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87

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