RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ASB4	Q9Y574	426 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS38	A1L453	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ACOD1	A6NK06	481 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PAH	P00439	452 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ALDOB	P05062	364 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PRR35	P0CG20	571 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CCNO	P22674	350 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM23	P36406	574 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RAB11B	Q15907	218 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TANK	Q92844	425 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35B4	Q969S0	331 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PDXP	Q96GD0	296 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GDE1	Q9NZC3	331 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RFPL3	O75679	317 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GPX5	O75715	221 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CLRN1	P58418	232 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RAB2A	P61019	212 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GHSR	Q92847	366 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ARSG	Q96EG1	525 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZBP1	Q9H171	429 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	POLE3	Q9NRF9	147 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CDC14C	A4D256	554 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf105	B2RV13	164 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		H3BNC9	293 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS11D	O60235	418 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	APBB3	O95704	486 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	F13B	P05160	661 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PBX2	P40425	430 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21	1e-6	■■□□□ 14.1
NEK1-208	ENST00000512193	RAB30	Q15771	203 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SYT14P1	Q58G82	188 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ELP2	Q6IA86	826 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM205	Q6UW68	189 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GPR148	Q8TDV2	347 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL15	Q96M94	604 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RCE1	Q9Y256	329 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WUU8	490 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF806	P0C7X5	589 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	F3	P13726	295 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	AKR1C4	P17516	323 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PDX1	P52945	283 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PRPS1	P60891	318 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	REEP5	Q00765	189 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SNTA1	Q13424	505 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PDE7A	Q13946	482 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	POU4F3	Q15319	338 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	P2RY14	Q15391	338 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FAM189A2	Q15884	450 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TM9SF4	Q92544	642 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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