RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.41■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.41■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.41■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.41■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 BHLHE40O14503 412 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SOCS6O14544 535 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 NGFRP08138 427 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 VWA2Q5GFL6 755 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 PHC2Q8IXK0 858 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CMIPQ8IY22 773 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 NACC2Q96BF6 587 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 FGF21Q9NSA1 209 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 HTR1FP30939 366 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V1E1P36543 226 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ULK3Q6PHR2 472 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 GATSQ8NAP1 163 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SLC35B4Q969S0 331 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 CACNA1EQ15878 2313 aa15.4■□□□□ 0.06
TOM1-216ENST00000492723 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TMEM129A0AVI4 362 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 MAGEB3O15480 346 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 RORAP35398 523 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 OAFQ86UD1 273 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 LNX2Q8N448 690 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 MED20Q9H944 212 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 STUB1Q9UNE7 303 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 AGRPO00253 132 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 HCN1O60741 890 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TSPAN19P0C672 248 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 LIMS3P0CW19 117 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 LIMS4P0CW20 117 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 HPGDP15428 266 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CRYBB2P43320 205 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 PPICP45877 212 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 EFNA3P52797 238 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 KMT5CQ86Y97 462 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 DEFB123Q8N688 67 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CPED1A4D0V7 1026 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 EFCAB7A8K855 629 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CD79BP40259 229 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 SLC1A3P43003 542 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 COPZ1P61923 177 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 NSDHLQ15738 373 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 KLHL26Q53HC5 615 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TM9SF4Q92544 642 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 DACH2Q96NX9 599 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GX78 115 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 PTP4A3O75365 173 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CPEP16870 476 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ZNF12P17014 697 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 SOX6P35712 828 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 FOXK2Q01167 660 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ATP1A4Q13733 1029 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 GID4Q8IVV7 300 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TMEM203Q969S6 136 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 CFL2Q9Y281 166 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.38■□□□□ 0.05
TOM1-216ENST00000492723 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms