RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480158.1

HERC4-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HERC4, Length 2,438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-210ENST00000480158 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 C7orf34Q96L11 122 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NPAS1Q99742 590 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 S100A14Q9HCY8 104 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 IL1RAPQ9NPH3 570 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 OLAHQ9NV23 265 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CNIH4Q9P003 139 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 A0A1W2PQD3 144 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 H3BNX3 289 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 FFAR1O14842 300 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NGFRP08138 427 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 GUSBP08236 651 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 UMPSP11172 480 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CNR1P21554 472 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 HTR2AP28223 471 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 LCN1P31025 176 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TAS2R41P59536 307 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 COPZ1P61923 177 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 PLGLB1Q02325 96 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 KCNC4Q03721 635 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 LINC00303Q3SY05 128 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 P3H2Q8IVL5 708 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 MDS2Q8NDY4 140 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 OR2M7Q8NG81 312 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 PMM1Q92871 262 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ARHGDIGQ99819 225 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 PKP2Q99959 881 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 C12orf49Q9H741 205 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SYT5O00445 386 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SNX4O95219 450 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SEMG1P04279 462 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 RRM2P31350 389 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 MEOX1P50221 254 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 P2RX1P51575 399 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CDH12P55289 794 aa5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 SNTA1Q13424 505 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 LY6DQ14210 128 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 QPRTQ15274 297 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 OR1Q1Q15612 314 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NRF1Q16656 503 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ST3GAL2Q16842 350 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ZNF550Q7Z398 422 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CMIPQ8IY22 773 aa5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 OR5W2Q8NH69 310 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 TM9SF4Q92544 642 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
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HERC4-210ENST00000480158 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 NINQ8N4C6 2090 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC4-210ENST00000480158 CACNA1GO43497 2377 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 ZNHIT1O43257 154 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 NME2P1O60361 137 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 E2F6O75461 281 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 ITGB2P05107 769 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 CELA3AP09093 270 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 NME2P22392 152 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 MST1P26927 711 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-210ENST00000480158 GDF1P27539 372 aa5.84□□□□□ -1.48
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