RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469941.5

PCNP-204, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNP, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-204ENST00000469941 NR5A2O00482 541 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 AP3D1O14617 1153 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 DVL2O14641 736 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CXCL13O43927 109 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 KRT16P08779 473 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 UBL4AP11441 157 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SESN3P58005 492 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 RAC1P63000 192 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 QPRTQ15274 297 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 RGNQ15493 299 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 COMTD1Q86VU5 262 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 VRK2Q86Y07 508 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 OR5W2Q8NH69 310 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 LINC01560Q8TB33 94 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SPDL1Q96EA4 605 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CADP27708 2225 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 A0A1W2PNV4 684 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 AGAP5A6NIR3 686 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CLIC1O00299 241 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ANP32DO95626 131 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 BCHEP06276 602 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ENPP1P22413 925 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 KHKP50053 298 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 FAM27E3Q08E93 113 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GUSBP1Q15486 140 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 MISPQ8IVT2 679 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 OSTF1Q92882 214 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ITCHQ96J02 903 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 LIME1Q9H400 295 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.99□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 C7orf72A4D263 438 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 A8MXE2 369 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SOX30O94993 753 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 CGAP01215 116 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GKN3PP0CG01 181 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZNF17P17021 662 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 EDNRAP25101 427 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SIRPAP78324 504 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SGCBQ16585 318 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 MEIOBQ8N635 442 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ABHD3Q8WU67 409 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ARL5BQ96KC2 179 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TM9SF2Q99805 663 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 LAT2Q9GZY6 243 aa9.98□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 A0A087WZY1 265 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 AK1P00568 194 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 NR2F1P10589 423 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 PRG2P13727 222 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GCKP35557 465 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 HOXC5Q00444 222 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TLE4Q04727 773 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 SELPLGQ14242 412 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ADRM1Q16186 407 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TMEM19Q96HH6 336 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GALNT8Q9NY28 637 aa9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PCNP-204ENST00000469941 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms