RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.76□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.76□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TMEM247A6NEH6 219 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CLDN24A6NM45 220 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ADAMDEC1O15204 470 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 NTN1O95631 604 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 IL18BPO95998 194 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 OPN1LWP04000 364 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 BMP2P12643 396 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 IGFBP2P18065 325 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 IL11P20809 199 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 OPRM1P35372 400 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ARFIP2P53365 341 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CRISP3P54108 245 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 KCNJ10P78508 379 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PLAURQ03405 335 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 FOXF2Q12947 444 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 FADDQ13158 208 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 GNA13Q14344 377 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 RGNQ15493 299 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 OR2A2Q6IF42 318 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CMIPQ8IY22 773 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 LILRA2Q8N149 483 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TSPEARQ8WU66 669 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ST8SIA1Q92185 356 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ZNF524Q96C55 264 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TMEM19Q96HH6 336 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ADGRG7Q96K78 797 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PINK1Q9BXM7 581 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MRGBPQ9NV56 204 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CALML5Q9NZT1 146 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 VAPAQ9P0L0 249 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ZNF175Q9Y473 711 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 GMEB1Q9Y692 573 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MPDZO75970 2070 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PDZD2O15018 2839 aa8.75□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 GJE1A6NN92 205 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SYT5O00445 386 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TNFSF11O14788 317 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ANGPT2O15123 496 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EFNA2O43921 213 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 BCHEP06276 602 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 CRHP06850 196 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 NUDT7P0C024 238 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 FCGR2AP12318 317 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 NID1P14543 1247 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 IL7RP16871 459 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PGCP20142 388 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SLC6A8P48029 635 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 ASCL1P50553 236 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SELENBP1Q13228 472 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PON3Q15166 354 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 SGCBQ16585 318 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 HBMQ6B0K9 141 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 DPP10Q8N608 796 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 OR10D3Q8NH80 312 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.74□□□□□ -1.01
SRRT-208ENST00000469602 TMEM234Q8WY98 164 aa8.74□□□□□ -1.01
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