RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 MUC13Q9H3R2 512 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IL26Q9NPH9 171 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PROCRQ9UNN8 238 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 USF3Q68DE3 2245 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ABCA1O95477 2261 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPL8 197 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 H3BML4 177 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CLIC1O00299 241 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SDHDO14521 159 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS11DO60235 418 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 VAPBO95292 243 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CYC1P08574 325 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PRKAR1BP31321 381 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 NEK2P51955 445 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A2P55011 1212 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DIO3P55073 304 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR4D2P58180 307 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R39P59534 338 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V0D1P61421 351 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 VLDLRP98155 873 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RPA4Q13156 261 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NSDHLQ15738 373 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SYT16Q17RD7 645 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SMU1Q2TAY7 513 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 BCL7AQ4VC05 210 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FAM166AQ6J272 317 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TTC23LQ6PF05 361 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RAPH1Q70E73 1250 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MDGA2Q7Z553 956 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ISCA2Q86U28 154 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 KRT78Q8N1N4 520 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR2M7Q8NG81 312 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 OR52B2Q96RD2 323 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR52A5Q9H2C5 316 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CD300AQ9UGN4 299 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PKP3Q9Y446 797 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FAM234BA2RU67 622 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 AQP12BA6NM10 295 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 STX16O14662 325 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PFDN6O15212 129 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 VPS26AO75436 327 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DQB2P05538 268 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MMP2P08253 660 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 UMPSP11172 480 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CRYGSP22914 178 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PDHA2P29803 388 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A1P30825 629 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HMGCLP35914 325 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF136P52737 540 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC26A5P58743 744 aa5.56□□□□□ -1.52
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