RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FEZF1A0PJY2 475 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf47A7E2U8 309 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BTN3A3O00478 584 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS11O94810 467 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TPPPO94811 219 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLPSP04118 112 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT8P05787 483 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 THBS1P07996 1170 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ELFN1P0C7U0 828 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCRC1P31930 480 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX6P35712 828 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR8P51685 355 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHB3P54753 998 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2CBP62714 309 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2CAP67775 309 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM53BQ14153 422 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SIAH3Q8IW03 269 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8K5Q8NH50 307 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2E3Q969T4 207 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM19Q96E16 107 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RNFT2Q96EX2 444 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF558Q96NG5 402 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DERL3Q96Q80 235 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7D2Q96RA2 312 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EDEM2Q9BV94 578 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC8Q9BY41 377 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF22Q9HCT0 170 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 POMT2Q9UKY4 750 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GLOD5A6NK44 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOFO60613 162 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM6O95932 706 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1D-16P01601 117 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNX2Q13950 521 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LYPD4Q6UWN0 246 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCT2Q8NC54 265 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5J2Q8NH18 312 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WBP1LQ9NX94 342 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC3Q9P0I2 261 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MALT1Q9UDY8 824 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA2Q9UM82 520 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GTI1 187 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX12O00623 359 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF13O43567 381 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX2-2O95096 273 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOP08100 348 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LMO1P25800 156 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRA4P48169 554 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CTAG1AP78358 180 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MADCAM1Q13477 382 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF273Q14593 569 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TEAD2Q15562 447 aa3.34□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 DAPP1Q9UN19 280 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.34□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFS1P28331 727 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADPRHP54922 357 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC13P55735 322 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM11AP58511 58 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.34□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2L5Q8NG80 312 aa3.34□□□□□ -1.88
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