RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	CHP2	O43745	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	GNAO1	P09471	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	TPTE	P56180	551 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	VAMP2	P63027	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	SERTM1	A2A2V5	107 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	STOM	P27105	288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC26A5	P58743	744 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	UCN3	Q969E3	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ATG12	O94817	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ALPL	P05186	524 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MAP2K4	P45985	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	SOX2	P48431	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ALG14	Q96F25	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	GABRG3	Q99928	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	HSPA12A	O43301	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	CTSL	P07711	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	FPR3	P25089	353 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	GDF1	P27539	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	CD1C	P29017	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	PTPRR	Q15256	657 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10A2	Q9H208	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRF-205	ENST00000414879	POM121B	A6NF01	834 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879		K7ESM1	405 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	DSCR3	O14972	297 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TBX19	O60806	448 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CD40LG	P29965	261 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	FNTB	P49356	437 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TEK	Q02763	1124 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MAVS	Q7Z434	540 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SYT7	O43581	403 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ITGB2	P05107	769 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	FN3K	Q9H479	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC43A1	O75387	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	YES1	P07947	543 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	IRF2	P14316	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	APLNR	P35414	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR7A5	Q15622	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	LTB4R	Q15722	352 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879		A0A1B0GVC2	190 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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