RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 ALG6Q9Y672 507 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 R4GN34 69 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 RYR1P21817 5038 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 PFASO15067 1338 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GRIN2DO15399 1336 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A0J9YVX5 310 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SDR42E2A6NKP2 422 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 G3V4G9 280 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 K7EMT4 169 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 PDLIM1O00151 329 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACSL4O60488 711 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TSPAN9O75954 239 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGLV2-23P01705 113 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CD74P04233 296 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GSTA1P08263 222 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 INAFM2P0DMQ5 153 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ALPPL2P10696 532 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 IL9P15248 144 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GJB2P29033 226 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TM4SF1P30408 202 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEA3P43357 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SYKP43405 635 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 NAMPTP43490 491 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CXCL12P48061 93 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 RND3P61587 244 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GABPAQ06546 454 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ST3GAL4Q11206 333 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ERCC8Q13216 396 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 HEPACAMQ14CZ8 416 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPHARQ15513 63 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRADDQ15628 312 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC30Q5VVM6 783 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACSM5Q6NUN0 579 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZFP1Q6P2D0 407 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 LYPD2Q6UXB3 125 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYP26C1Q6V0L0 522 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 KDM7AQ6ZMT4 941 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYS1Q717R9 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERPINA9Q86WD7 417 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 HEATR4Q86WZ0 1026 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF679Q8IYX0 411 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SFRP1Q8N474 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SNX31Q8N9S9 440 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR9A4Q8NGU2 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPATA18Q8TC71 538 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 UCMAQ8WVF2 138 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 C17orf50Q8WW18 174 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC5A11Q8WWX8 675 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 AKR1E2Q96JD6 320 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 PITX2Q99697 317 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 MCHR1Q99705 422 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 AGPAT1Q99943 283 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ECSITQ9BQ95 431 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SRXN1Q9BYN0 137 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAB34Q9BZG1 259 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ABCG5Q9H222 651 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCL28Q9NRJ3 127 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 OLAHQ9NV23 265 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ANKMY1Q9P2S6 941 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 RNF14Q9UBS8 474 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ENOPH1Q9UHY7 261 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GPR52Q9Y2T5 361 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 GBF1Q92538 1859 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 ROS1P08922 2347 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIP11Q15643 1979 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNCP24821 2201 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 SYNJ2O15056 1496 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 FGD5Q6ZNL6 1462 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms