RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.93□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 AKAP12Q02952 1782 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 POM121CA8CG34 1229 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 RASAL1O95294 804 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MT-ND2P03891 347 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 HOXD13P35453 343 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IKZF1Q13422 519 aa9.92□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 MRI1Q9BV20 369 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CUTCQ9NTM9 273 aa9.92□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 GTDC1Q4AE62 458 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.92□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.92□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM104Q8NE00 496 aa9.91□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 LGALS4P56470 323 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MC2RQ01718 297 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.91□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NR4A3Q92570 626 aa9.91□□□□□ -0.82
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