RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SMARCD2Q92925 531 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MSANTD3Q96H12 275 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HS6ST2Q96MM7 605 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 WDFY2Q96P53 400 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR14A2Q96R54 314 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 WASH6PQ9NQA3 447 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 REV3LO60673 3130 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 IRGMA1A4Y4 181 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RGS13O14921 159 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DOK2O60496 412 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ICMTO60725 284 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TIMP1P01033 207 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FOXK2Q01167 660 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 YIF1BQ5BJH7 314 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SSX6Q7RTT6 188 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZAR1Q86SH2 424 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CDH24Q86UP0 819 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TEAD3Q99594 435 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 NPAP1Q9NZP6 1156 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MED31Q9Y3C7 131 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SGK494L7N484 410 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HTR1FP30939 366 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 GJA4P35212 333 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 STAT5AP42229 794 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR3A3P47888 321 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TFF2Q03403 129 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A25Q6KCM7 469 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PRSS58Q8IYP2 241 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TSSK2Q96PF2 358 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DERL3Q96Q80 235 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SPEF1Q9Y4P9 236 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CACNG2Q9Y698 323 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TSPAN11A1L157 253 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DUXAA6NLW8 204 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 24.4
TMOD1-201ENST00000259365 STOMP27105 288 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DPTQ07507 201 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RUNX2Q13950 521 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ASPGQ86U10 573 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CEP76Q8TAP6 659 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PTP4A1Q93096 173 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SDF2Q99470 211 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MARK1Q9P0L2 795 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 B3GALT2O43825 422 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 IFNA16P05015 189 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RAB3BP20337 219 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HSD17B2P37059 387 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP19Q14CB8 494 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BICRALQ6AI39 1079 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00471Q8N535 108 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PEX11GQ96HA9 241 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SEMA4CQ9C0C4 833 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 IL21RQ9HBE5 538 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CALML5Q9NZT1 146 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 C4orf47A7E2U8 309 aa12.42□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 STK25O00506 426 aa12.42□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CRYZL1O95825 349 aa12.42□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TFPIP10646 304 aa12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms