RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088653.2

Ccdc87-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Ccdc87, Length 3,163 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa9.6□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 SmoxQ99K82 555 aa9.6□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Tktl1Q99MX0 595 aa9.6□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gpr88Q9EPB7 384 aa9.6□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rgs6Q9Z2H2 472 aa9.6□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 A0A286YD17 136 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 6330409D20RikA2AK85 162 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 BC035947B2RQY6 695 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Pcdh1F7BJK1 1077 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Ido1P28776 407 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 CtgfP29268 348 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gstm5P48774 224 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Limk1P53668 647 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Commd6Q3V4B5 87 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gm527Q4KL13 310 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Surf4Q64310 269 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Tas2r117Q7M715 330 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Lamp3Q7TST5 411 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Aldh3b1Q80VQ0 468 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Serpina3fQ80X76 445 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Prap1Q80XD8 149 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 NapepldQ8BH82 396 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Nyap2Q8BM65 682 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Ahsa2Q8N9S3 331 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Vmn1r83Q8R287 306 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr1284Q8VF29 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr582Q8VGV9 319 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rab40bQ8VHP8 278 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Klhl22Q99JN2 634 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Hrasls5Q9CPX5 270 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 PaplnQ9EPX2 1280 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Ccdc166S4R181 449 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Dock8Q8C147 2100 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Tbc1d25A1A5B6 742 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Zfp978A2A7I1 335 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Spata6lB2RV46 347 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Gm20403G3UYB0 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 2410141K09RikK7N769 464 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc10a1O08705 362 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Dscr3O35075 297 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 C1dO35473 141 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Nme6O88425 189 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Hoxa2P31245 372 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 SgcdP82347 289 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Q3U6N9 222 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Spag8Q3V0Q6 470 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc35g3Q5F297 340 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Ffar4Q7TMA4 361 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr301Q7TS04 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 JamlQ80UL9 379 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Chst14Q80V53 376 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 TufmQ8BFR5 452 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Nabp1Q8BGW5 198 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Nmral1Q8K2T1 309 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Cadm4Q8R464 388 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr1232Q8VEX7 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr474Q8VFC9 310 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr1361Q8VFH0 317 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr170Q8VGL6 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr658Q8VGV5 323 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Dnase2bQ9QY48 354 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 RfxankQ9Z205 269 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Heatr5bQ8C547 2070 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc25a43A2A3V2 341 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr619E9PV95 320 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr653E9PVA0 317 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Vmn2r110E9PWD5 858 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Olfr543E9PWI5 336 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rdh19G5E8H9 318 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Zfp994J3QM38 661 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Syt3O35681 587 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc16a7O70451 484 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Capns1O88456 269 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Csf2P01587 141 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Etv1P41164 477 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Sox3P53784 375 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rack1P68040 317 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Cmklr1P97468 371 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc22a13Q6A4L0 551 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Zar1Q80SU3 361 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Agfg2Q80WC7 479 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Nceh1Q8BLF1 408 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Dusp28Q8BTR5 163 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 SprnQ8BWU1 147 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rab43Q8CG50 210 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Rhbdl1Q8VC82 373 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Slc3a1Q91WV7 685 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Chrm5Q920H4 532 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 P2ry12Q9CPV9 347 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa9.59□□□□□ -0.87
Ccdc87-201ENSMUST00000088653 Etv5Q9CXC9 510 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49 ms