Protein–RNA interactions for Protein: O35681

Syt3, Synaptotagmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt3O35681 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Syt3O35681 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Syt3O35681 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Syt3O35681 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Syt3O35681 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Syt3O35681 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Syt3O35681 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Syt3O35681 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Syt3O35681 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Syt3O35681 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Syt3O35681 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Syt3O35681 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Syt3O35681 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Syt3O35681 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Syt3O35681 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Syt3O35681 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Syt3O35681 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Syt3O35681 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Syt3O35681 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syt3O35681 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Syt3O35681 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Syt3O35681 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Syt3O35681 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syt3O35681 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Syt3O35681 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Syt3O35681 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Syt3O35681 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syt3O35681 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Syt3O35681 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syt3O35681 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Syt3O35681 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syt3O35681 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Syt3O35681 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Syt3O35681 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Syt3O35681 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syt3O35681 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Syt3O35681 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syt3O35681 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syt3O35681 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syt3O35681 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syt3O35681 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syt3O35681 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syt3O35681 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syt3O35681 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syt3O35681 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syt3O35681 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Syt3O35681 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syt3O35681 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syt3O35681 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Syt3O35681 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syt3O35681 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syt3O35681 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syt3O35681 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syt3O35681 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syt3O35681 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syt3O35681 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syt3O35681 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Syt3O35681 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syt3O35681 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt3O35681 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt3O35681 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Syt3O35681 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syt3O35681 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt3O35681 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syt3O35681 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syt3O35681 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Syt3O35681 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syt3O35681 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syt3O35681 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syt3O35681 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Syt3O35681 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt3O35681 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt3O35681 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt3O35681 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syt3O35681 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt3O35681 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syt3O35681 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt3O35681 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt3O35681 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt3O35681 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Syt3O35681 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt3O35681 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt3O35681 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt3O35681 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Syt3O35681 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syt3O35681 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syt3O35681 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Syt3O35681 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syt3O35681 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syt3O35681 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syt3O35681 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syt3O35681 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Syt3O35681 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syt3O35681 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syt3O35681 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syt3O35681 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Syt3O35681 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syt3O35681 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syt3O35681 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syt3O35681 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms