RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntng1Q8R4G0 539 aa20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ing3Q8VEK6 421 aa20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr938Q9EQ93 315 aa20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itpr3P70227 2670 aa20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp600A2A7V0 737 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp937A2ANU7 503 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aldoart2A6ZI47 364 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem92B7ZWI3 162 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp738B8JJX8 793 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam71dD3YV92 440 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Papss2O88428 621 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-LP01897 362 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C2cd4dP0CG09 341 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxa10P31310 416 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ackr3P56485 362 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Has2P70312 552 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcst1Q059Y8 732 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctu2Q3U308 514 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nxf3Q4ZGD9 553 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr146Q60884 306 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tas2r107Q7M725 308 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PimregQ8BFY7 231 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxw13Q8BI57 466 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Noxa1Q8CJ00 444 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snapc1Q8K0S9 389 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Galnt18Q8K1B9 622 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r75Q8R289 305 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr883Q8VF64 309 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asb17Q8VHP9 295 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sfxn2Q925N2 322 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd10Q99LW0 415 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OgfrQ99PG2 633 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MmachcQ9CZD0 279 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Med8Q9D7W5 268 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11983V9GXS8 105 aa19.99■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc120A2AEV7 629 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TagapB2RWW0 714 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prr36E9PV26 1098 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C2cd2E9Q3C1 696 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PahP16331 453 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Awat2Q6E1M8 333 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dusp28Q8BTR5 163 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spata33Q8C624 132 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SrrdQ8K2M3 249 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr643Q8VGY1 314 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nupr1Q9WTK0 80 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tbk1Q9WUN2 729 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cxcl15Q9WVL7 167 aa19.98■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp969A2ART2 485 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp973A2BE20 318 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Efna4O08542 206 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ulk1O70405 1051 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klk1b1P00755 261 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dpy19l2P0CW70 773 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apoa1Q00623 264 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eps8Q08509 821 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdh12Q5RJH3 794 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC080695Q66JY9 481 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IppkQ6P1C1 489 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1167Q7TR26 316 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gramd1bQ80TI0 738 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim36Q80WG7 729 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mfsd8Q8BH31 519 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MkxQ8BIA3 353 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Reep4Q8K072 257 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr449Q8VGW8 311 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fig4Q91WF7 907 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nkd1Q99MH6 471 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dsn1Q9CYC5 348 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9D3J9 298 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cers4Q9D6J1 393 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcb10Q9JI39 715 aa19.97■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1338A2ACY7 313 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mybpc1D3YU50 1127 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clk3O35492 638 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rad51dO55230 329 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P03987 398 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LipcP27656 510 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defa8P50706 81 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptchd3Q0EEE2 906 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defb33Q30KN3 62 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zmat1Q3V0C1 714 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr325Q5NCD2 326 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grb10Q60760 621 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DmknQ6P253 517 aa19.96■□□□□ 0.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp184Q7TSH9 737 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.9 ms