RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA10O75578 1167 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGAMP11215 1152 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1RL1Q01638 556 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CHAF1BQ13112 559 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CBLN3Q6UW01 205 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO6Q96DC7 493 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LAT2Q9GZY6 243 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J2E0 115 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GX12 115 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFB5O43674 189 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAP00813 363 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GNAO1P09471 354 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PDK3Q15120 406 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NTRK2Q16620 822 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC23Q5W5X9 447 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 USP51Q70EK9 711 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GRHL3Q8TE85 626 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP250Q9BV73 2442 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GWA3 101 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A6O15403 523 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL1O95841 491 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RYKP34925 604 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RTP5Q14D33 572 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TGIF1Q15583 401 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 DGCR6LQ9BY27 220 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NTN1O95631 604 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA7P05543 415 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPCP11150 499 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 POU2F1P14859 743 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MYF6P23409 242 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MLF1P58340 268 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF117Q03924 483 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1A4Q13733 1029 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 IP6K3Q96PC2 410 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 E9PQ18 207 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CHP2O43745 196 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SCO2O43819 266 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN1A2O60476 641 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CLIC3O95833 236 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LINGO3P0C6S8 592 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX3P41225 446 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NPRL3Q12980 569 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MISPQ8IVT2 679 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP8Q8N3A8 854 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2B15P54855 530 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 FCRLBQ6BAA4 426 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ULK3Q6PHR2 472 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 OPN5Q6U736 354 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CADM2Q8N3J6 435 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HEATR5AQ86XA9 2040 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HCRTR2O43614 444 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 LIFP15018 202 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNGR2P38484 337 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A8P48029 635 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS1P54826 345 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 COPZ1P61923 177 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.75■■□□□ 1.23
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