RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598258.5

TMEM143-208, Transcript of transmembrane protein 143, human

TSL 4

Gene TMEM143, Length 457 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM143-208	ENST00000598258	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258		A0A0J9YW62	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	C7orf72	A4D263	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TNFSF13	O75888	250 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AQP8	O94778	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	NID1	P14543	1247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	HPGD	P15428	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	PRKCA	P17252	672 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	BMP5	P22003	454 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	P2RX1	P51575	399 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AGK	Q53H12	422 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	STON2	Q8WXE9	905 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ITCH	Q96J02	903 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	POLQ	O75417	2590 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258		A0A0G2JND7	137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF264	O43296	627 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AK1	P00568	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	GUSB	P08236	651 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	UBL4A	P11441	157 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	PEPD	P12955	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF17	P17021	662 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	KLK2	P20151	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ATP4B	P51164	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SQLE	Q14534	574 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MAL2	Q969L2	176 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258		A0A096LPI6	279 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AP3D1	O14617	1153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SOX30	O94993	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	RCBTB2	O95199	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	CSTA	P01040	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	IL2RA	P01589	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	STX1B	P61266	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SELPLG	Q14242	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	QPRT	Q15274	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	RGN	Q15493	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	HSPB2	Q16082	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	VWA1	Q6PCB0	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	WNT2B	Q93097	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258		A0A087WZY1	265 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	CLIC1	O00299	241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	FBP2	O00757	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM143-208	ENST00000598258	TNFSF11	O14788	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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