RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589686.5

CIRBP-224, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 2

Gene CIRBP, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-224	ENST00000589686	RNF130	Q86XS8	419 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	POC1B	Q8TC44	478 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	GPR119	Q8TDV5	335 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	HMGN4	O00479	90 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ADAMDEC1	O15204	470 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	KIAA0513	O60268	411 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	GSN	P06396	782 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	FCGR2A	P12318	317 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ELK4	P28324	431 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	HPCA	P84074	193 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	OR5W2	Q8NH69	310 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ARSG	Q96EG1	525 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	LAT2	Q9GZY6	243 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	RMND5A	Q9H871	391 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	RNF122	Q9H9V4	155 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	LIPT1	Q9Y234	373 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CIRBP-224	ENST00000589686	KRT75	O95678	551 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MAGEA8	P43361	318 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CPA2	P48052	419 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	IDH3A	P50213	366 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	KRTAP10-9	P60411	292 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	STX1B	P61266	288 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	SORD	Q00796	357 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FUT5	Q11128	374 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FOXF1	Q12946	379 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CBFB	Q13951	182 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FGFBP1	Q14512	234 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	GPAT3	Q53EU6	434 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	LUZP2	Q86TE4	346 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	LILRA2	Q8N149	483 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	OR10D3	Q8NH80	312 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ITCH	Q96J02	903 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ADGRG7	Q96K78	797 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	PDZD2	O15018	2839 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM234B	A2RU67	622 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ANP32D	O95626	131 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CSTA	P01040	98 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	C1QC	P02747	245 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	OPN1LW	P04000	364 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	PRKCA	P17252	672 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CCR4	P51679	360 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	SKP2	Q13309	424 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MAPK14	Q16539	360 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FBXO27	Q8NI29	283 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM222B	Q8WU58	562 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	STARD4	Q96DR4	205 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	KLHL15	Q96M94	604 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		18.88	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686		A0A0J9YW62	118 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	GJE1	A6NN92	205 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686		A8MXE2	369 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	TNFSF11	O14788	317 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	MSTN	O14793	375 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	DNAJA2	O60884	412 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	CYP7B1	O75881	506 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	SYNGR4	O95473	234 aa		18.87	■□□□□ 0.61
CIRBP-224	ENST00000589686	H6PD	O95479	791 aa		18.87	■□□□□ 0.61

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