RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	USH1G	Q495M9	461 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	UNC50	Q53HI1	259 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C12orf60	Q5U649	245 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	EMB	Q6PCB8	327 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	VIT	Q6UXI7	678 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ASRGL1	Q7L266	308 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	BATF2	Q8N1L9	274 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	BEST4	Q8NFU0	473 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	OR4F5	Q8NH21	305 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	URGCP	Q8TCY9	931 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SPATA13	Q96N96	652 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RUFY1	Q96T51	708 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CPQ	Q9Y646	472 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ABCB11	O95342	1321 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PDZD2	O15018	2839 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	BSN	Q9UPA5	3926 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SYCE3	A1L190	88 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RNF212B	A8MTL3	300 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084		K7ENP7	123 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SH2D1B	O14796	132 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PRKAB2	O43741	272 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	NME2P1	O60361	137 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	APRT	P07741	180 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	STMN1	P16949	149 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	AHCY	P23526	432 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ACADSB	P45954	432 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SST	P61278	116 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SP4	Q02446	784 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	DMC1	Q14565	340 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	EMC2	Q15006	297 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	VWA2	Q5GFL6	755 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LIN9	Q5TKA1	542 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LIPJ	Q5W064	366 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LEMD1	Q68G75	181 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	REP15	Q6BDI9	236 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FAM228A	Q86W67	206 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LEMD2	Q8NC56	503 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RLN3	Q8WXF3	142 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	P3H4	Q92791	437 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	B3GALT6	Q96L58	329 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ABCG8	Q9H221	673 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084		Q9HAA7	133 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ANO10	Q9NW15	660 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FETUB	Q9UGM5	382 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MYH4	Q9Y623	1939 aa		2.55	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MED13	Q9UHV7	2174 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	VWA8	A3KMH1	1905 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	UBE4B	O95155	1302 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		2.54	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SH3BGRL	O75368	114 aa		2.54	□□□□□ -2

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