RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558342.1

AC105339.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC105339.2, Length 1,091 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC105339.2-201ENST00000558342 PUDPQ08623 228 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RAB40BQ12829 278 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 IL18R1Q13478 541 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CUL1Q13616 776 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CCL14Q16627 93 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PCK2Q16822 640 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TP53I3Q53FA7 332 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 LGSNQ5TDP6 509 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ATL3Q6DD88 541 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 OR2A2Q6IF42 318 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SPATA24Q86W54 205 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 MTURNQ8N3F0 131 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 C8orf76Q96K31 380 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 OR5B2Q96R09 309 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 NUP58Q9BVL2 599 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 JPT2Q9H910 190 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CRLF2Q9HC73 371 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RNF24Q9Y225 148 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 A0A075B6Q4 140 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 HEATR9A2RTY3 570 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 DIRAS1O95057 198 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PGK1P00558 417 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SERPINB2P05120 415 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 LMO2P25791 158 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RFC4P35249 363 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 EFNB2P52799 333 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 C1orf61Q13536 156 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CRMP1Q14194 572 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 LAGE3Q14657 143 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SLC10A1Q14973 349 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 STK11Q15831 433 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 NDUFA9Q16795 377 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TEX44Q53QW1 395 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SFT2D3Q587I9 215 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 BEND3Q5T5X7 828 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 KRT222Q8N1A0 295 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 BBOF1Q8ND07 529 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 C10orf35Q96D05 121 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 DUX3Q96PT4 197 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SH3GL1Q99961 368 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CITED1Q99966 193 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 GAL3ST1Q99999 423 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 AMBNQ9NP70 447 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TIGARQ9NQ88 270 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ACOD1A6NK06 481 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 H0YIV9 168 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ZNF254O75437 659 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 NDUFB10O96000 172 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 AGTP01019 485 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CFC1BP0CG36 223 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CFC1P0CG37 223 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 HMGCLP35914 325 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 GSK3BP49841 420 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 RND3P61587 244 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 TGM3Q08188 693 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ST3GAL3Q11203 375 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 CYP51A1Q16850 503 aa4.86□□□□□ -1.63
AC105339.2-201ENST00000558342 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms