RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CTSB-231	ENST00000534382		A0A1W2PP18	115 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	DVL2	O14641	736 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CYP7B1	O75881	506 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RCBTB2	O95199	551 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	COX6B1	P14854	86 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CD1E	P15812	388 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CTSS	P25774	331 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ADH6	P28332	368 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	DSTN	P60981	165 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RAC1	P63000	192 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	KCNJ10	P78508	379 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SKP2	Q13309	424 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RGN	Q15493	299 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	DNAJA2	O60884	412 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TGM6	O95932	706 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	IL18BP	O95998	194 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	BMP5	P22003	454 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ME2	P23368	584 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PGM1	P36871	562 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CCR4	P51679	360 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	FOXF1	Q12946	379 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CBFB	Q13951	182 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	MAPK11	Q15759	364 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	GGN	Q86UU5	652 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	OPN1LW	P04000	364 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	BCHE	P06276	602 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PRKCA	P17252	672 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	PGC	P20142	388 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ELK4	P28324	431 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	OPRM1	P35372	400 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	ARFIP2	P53365	341 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CRISP3	P54108	245 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	FADD	Q13158	208 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	QPRT	Q15274	297 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SGCB	Q16585	318 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTSB-231	ENST00000534382	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.06	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms