RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR3	P46089	330 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC6A8	P48029	635 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL4D	P49703	201 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPS1	P60891	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXK2	Q01167	660 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	HSF2	Q03933	536 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	FUT7	Q11130	342 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	OAF	Q86UD1	273 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	TPRA1	Q86W33	373 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	OTULIN	Q96BN8	352 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	CD93	Q9NPY3	652 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	BHLHE40	O14503	412 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CASK	O14936	926 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HR	O43593	1189 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CDRT1	O95170	752 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DLGAP3	O95886	979 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MSL3P1	P0C860	447 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FUT4	P22083	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFSF8	P32971	234 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGER1	P34995	402 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	RORA	P35398	523 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MTNR1B	P49286	362 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	EMD	P50402	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GAS1	P54826	345 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GPLD1	P80108	840 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PSG6	Q00889	435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ID2	Q02363	134 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GALE	Q14376	348 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	STEAP3	Q658P3	488 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	LMX1A	Q8TE12	382 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PATE1	Q8WXA2	126 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DPH1	Q9BZG8	443 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR10A5	Q9H207	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GWA3	101 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PR77	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PEX12	O00623	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SCD	O00767	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DUX1	O43812	170 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CSTA	P01040	98 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNA16	P05015	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CD1A	P06126	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	IGFBP4	P22692	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL9	P24844	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HTR2A	P28223	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PPIC	P45877	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf61	Q13536	156 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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