RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC51BQ86UW2 128 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPG21Q9NZD8 308 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1GO43497 2377 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL12BO14950 172 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ORC5O43913 435 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 VEGFDO43915 354 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFAP04085 211 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CPN1P15169 458 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL12AP19105 171 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL2P19875 107 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LSSP48449 732 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP15P51511 669 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMSP52788 366 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PSG6Q00889 435 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC1AQ8NC01 280 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HYLS1Q96M11 299 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SDF2Q99470 211 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SATB2Q9UPW6 733 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RASD1Q9Y272 281 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP4O75096 1905 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMCC2O75069 709 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KELP23276 732 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR12D2P58182 307 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK3Q00526 305 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SP3Q02447 781 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CRMP1Q14194 572 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GALEQ14376 348 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP5Q16690 384 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPERTQ8NA61 448 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MED8Q96G25 268 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTM3Q96MX0 182 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDND1Q9NY35 253 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC3AQ02505 3323 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GVC2 190 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NIN4 97 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RX6O15547 441 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFPL1O95159 310 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPPL2P10696 532 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 STAT5AP42229 794 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GCGRP47871 477 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN2P57739 230 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB3Q12988 150 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LTB4RQ15722 352 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR135Q8IZ08 494 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2L3Q8NG85 312 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OPN4Q9UHM6 478 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYZL1O95825 349 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CBX7O95931 251 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FGBP02675 491 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MC3RP41968 323 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR9P51686 369 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EFNA3P52797 238 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAM2Q15035 370 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRA1Q86W33 373 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ESX1Q8N693 406 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GLTPQ9NZD2 209 aa3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SSR3Q9UNL2 185 aa3.34□□□□□ -1.87
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