RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 A0A0J9YY10 115 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 S1PR4O95977 384 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 HTR2AP28223 471 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PKDCCQ504Y2 493 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SFXN5Q8TD22 340 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.93□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 FOXQ1Q9C009 403 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 K7EPK0 472 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SNAPC5O75971 98 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IL2RGP31785 369 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CPOQ8IVL8 374 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.93□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.93□□□□□ -0.82
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