RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRA3P34903 492 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB4P48594 390 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC18A2Q05940 514 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENBP1Q13228 472 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NAB1Q13506 487 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7G2Q8NG99 324 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR151Q8TDV0 419 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 APH1AQ96BI3 265 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A14Q96JA4 679 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK15Q96Q40 435 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf51A8MQB3 221 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 B4DXG7 233 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 E7ESA3 106 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF195O14628 629 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 STX16O14662 325 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH7O60245 1069 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CYTIPO60759 359 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL10O95999 233 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 AVPP01185 164 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IL3P08700 152 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP1P09455 135 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TACSTD2P09758 323 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI6P09912 130 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ANPEPP15144 967 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1-2P23083 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GIFP27352 417 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TYK2P29597 1187 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINF1P36955 418 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC1A3P43003 542 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PPOXP50336 477 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH15P55291 814 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HILS1P60008 231 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPS1P60891 318 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DR1Q01658 176 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP2Q05923 314 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CALCOCO2Q13137 446 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MIDNQ504T8 468 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 AWAT1Q58HT5 328 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL5BQ96KC2 179 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PSD2Q9BQI7 771 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF747Q9BV97 191 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UPB1Q9UBR1 384 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS50Q9UI38 385 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 USP22Q9UPT9 525 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQD3 144 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP5LA4QPB2 252 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7A17O14581 309 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS2O15393 492 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6HO94772 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL2O95198 593 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 STAMBPO95630 424 aa6.9□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NTN1O95631 604 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms